De acuerdo a la Norma ISO 9001, un SGC “comprende actividades mediante las cuales la organización identifica sus objetivos y determina los procesos y recursos requeridos para lograr los resultados deseados.” Para la UAEM, el SGC otorga mayor consistencia y claridad en los servicios para la comunidad universitaria, promueve disciplina y estandarización en los procesos, optimización de los recursos, así como mayor liderazgo y compromiso del personal directivo y operativo, con un enfoque basado en procesos y decisiones basadas en evidencias. Actualmente el Sistema de Gestión de la Calidad está integrado por 20 procesos administrativos estratégicos, con certificado bajo la norma ISO 9001:2015, los cuales comprenden las áreas de Servicios Escolares, Financieros, Personal y Bibliotecas (SEFIPEBI).